MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides salanitronis DSM 18170 plasmid pBACSA03

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015166	CTT	2	6	133	138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
2	NC_015166	TTC	2	6	156	161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
3	NC_015166	TGT	2	6	166	171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959702
4	NC_015166	T	6	6	171	176	0 %	100 %	0 %	0 %	324959702
5	NC_015166	TGT	2	6	226	231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959702
6	NC_015166	TTC	2	6	237	242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
7	NC_015166	TCT	2	6	296	301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
8	NC_015166	TTTC	2	8	350	357	0 %	75 %	0 %	25 %	324959702
9	NC_015166	TTC	2	6	367	372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
10	NC_015166	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	324959702
11	NC_015166	TCTGT	2	10	460	469	0 %	60 %	20 %	20 %	324959702
12	NC_015166	TTC	3	9	496	504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
13	NC_015166	TGGT	2	8	511	518	0 %	50 %	50 %	0 %	324959702
14	NC_015166	GAT	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959702
15	NC_015166	TGC	2	6	676	681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324959702
16	NC_015166	CAT	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959702
17	NC_015166	TTG	3	9	817	825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959702
18	NC_015166	TTC	2	6	901	906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
19	NC_015166	TCCTT	2	10	1015	1024	0 %	60 %	0 %	40 %	324959703
20	NC_015166	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959703
21	NC_015166	AGC	2	6	1056	1061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959703
22	NC_015166	AGGA	2	8	1083	1090	50 %	0 %	50 %	0 %	324959703
23	NC_015166	ATA	2	6	1149	1154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324959703
24	NC_015166	TTC	2	6	1161	1166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959703
25	NC_015166	CTGCC	2	10	1201	1210	0 %	20 %	20 %	60 %	324959703
26	NC_015166	GTT	2	6	1223	1228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959703
27	NC_015166	TTG	2	6	1263	1268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959703
28	NC_015166	TTC	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959703
29	NC_015166	TG	3	6	1329	1334	0 %	50 %	50 %	0 %	324959703
30	NC_015166	TTC	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959703
31	NC_015166	AGT	2	6	1486	1491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959703
32	NC_015166	AC	3	6	1522	1527	50 %	0 %	0 %	50 %	324959703
33	NC_015166	AGT	2	6	1562	1567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959703
34	NC_015166	CTACCG	2	12	1573	1584	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	324959703
35	NC_015166	GTC	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324959704
36	NC_015166	TTC	2	6	2176	2181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959704
37	NC_015166	TCA	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959704
38	NC_015166	AGC	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959704
39	NC_015166	TCA	2	6	2315	2320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959704
40	NC_015166	ATC	2	6	2395	2400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959705
41	NC_015166	TTCCG	2	10	2433	2442	0 %	40 %	20 %	40 %	324959705
42	NC_015166	CT	3	6	2457	2462	0 %	50 %	0 %	50 %	324959705
43	NC_015166	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959705
44	NC_015166	CA	3	6	2511	2516	50 %	0 %	0 %	50 %	324959705
45	NC_015166	ATA	2	6	2519	2524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324959705
46	NC_015166	TCT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959705
47	NC_015166	TGT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959705
48	NC_015166	TAT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324959706
49	NC_015166	ACT	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959706
50	NC_015166	AGA	2	6	3226	3231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959706
51	NC_015166	GCCT	2	8	3276	3283	0 %	25 %	25 %	50 %	324959706
52	NC_015166	GAC	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959706
53	NC_015166	AAG	2	6	3322	3327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959706
54	NC_015166	GAT	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959706
55	NC_015166	GCCTT	2	10	3399	3408	0 %	40 %	20 %	40 %	324959706
56	NC_015166	TTC	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959706
57	NC_015166	TAT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324959706
58	NC_015166	AGC	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959706
59	NC_015166	GTT	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959706
60	NC_015166	CTC	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324959706
61	NC_015166	TGT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959706
62	NC_015166	TGC	2	6	3668	3673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324959706
63	NC_015166	A	7	7	3674	3680	100 %	0 %	0 %	0 %	324959706
64	NC_015166	TGA	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959706
65	NC_015166	AC	3	6	3715	3720	50 %	0 %	0 %	50 %	324959706
66	NC_015166	AAG	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959706
67	NC_015166	AGA	2	6	3991	3996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959706
68	NC_015166	TA	3	6	4008	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	324959706
69	NC_015166	AGAA	2	8	4044	4051	75 %	0 %	25 %	0 %	324959706
70	NC_015166	AAG	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959707
71	NC_015166	A	7	7	4272	4278	100 %	0 %	0 %	0 %	324959707
72	NC_015166	AAGC	2	8	4431	4438	50 %	0 %	25 %	25 %	324959708
73	NC_015166	TC	3	6	4531	4536	0 %	50 %	0 %	50 %	324959708
74	NC_015166	ATC	2	6	4609	4614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959708
75	NC_015166	TGAA	2	8	4622	4629	50 %	25 %	25 %	0 %	324959708
76	NC_015166	ACT	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959708
77	NC_015166	AAC	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324959708
78	NC_015166	TTC	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959708
79	NC_015166	TGA	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959708
80	NC_015166	TTC	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
81	NC_015166	TTA	2	6	5296	5301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324959709
82	NC_015166	AAG	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959709
83	NC_015166	TCA	2	6	5368	5373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959709
84	NC_015166	ATT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324959709
85	NC_015166	GCA	2	6	5509	5514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959709
86	NC_015166	T	6	6	5553	5558	0 %	100 %	0 %	0 %	324959709
87	NC_015166	CTT	2	6	5560	5565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
88	NC_015166	TTC	2	6	5578	5583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
89	NC_015166	TCT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
90	NC_015166	CTT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
91	NC_015166	CTGTT	2	10	5653	5662	0 %	60 %	20 %	20 %	324959709
92	NC_015166	TAC	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959709
93	NC_015166	TTC	2	6	5711	5716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
94	NC_015166	CATC	2	8	5812	5819	25 %	25 %	0 %	50 %	324959709
95	NC_015166	CAC	2	6	5828	5833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324959709
96	NC_015166	TGTT	2	8	5847	5854	0 %	75 %	25 %	0 %	324959709
97	NC_015166	TAA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324959709
98	NC_015166	T	6	6	6036	6041	0 %	100 %	0 %	0 %	324959709
99	NC_015166	CTT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
100	NC_015166	AAAG	2	8	6165	6172	75 %	0 %	25 %	0 %	324959709
101	NC_015166	AACAT	2	10	6173	6182	60 %	20 %	0 %	20 %	324959709
102	NC_015166	AATAA	2	10	6188	6197	80 %	20 %	0 %	0 %	324959709

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.